В письме Минфина России N 03-05-05-03/57135 от 25 декабря 2013 г. разъяснена позиция ведомства по поводу возврата госпошлины при отказе в выдаче разрешений, аттестатов или лицензий:
Пунктом 1 ст. 333.40 Налогового кодекса установлен исчерпывающий перечень, в соответствии с которым уплаченная государственная пошлина за совершение юридически значимых действий, предусмотренных гл. 25.3 НК РФ, подлежит возврату.
Согласно п. 1 ст. 333.40 НК РФ уплаченная государственная пошлина подлежит возврату частично или полностью, в частности, в случае уплаты государственной пошлины в большем размере, чем это предусмотрено гл. 25.3 Налогового кодекса, а также отказа лиц, уплативших государственную пошлину, от совершения юридически значимого действия до обращения в уполномоченный орган (к должностному лицу), совершающий (совершающему) данное юридически значимое действие.
Конституционный Суд Российской Федерации путем толкования преодолел неопределенность правового регулирования указанного вопроса, указав, что уполномоченный орган при отсутствии в ст. 333.40 Налогового кодекса оснований для возврата государственной пошлины не вправе принять произвольное решение по данному вопросу. В указанном Постановлении отмечено, что п. 1 ст. 333.40 Налогового кодекса как по своему буквальному смыслу, так и во взаимосвязи с положениями п. 1 ст. 333.33 Налогового кодекса не предполагает возврата государственной пошлины в случаях, не установленных в п. 1 ст. 333.40 Налогового кодекса.